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图1 核糖体测序和相关的高通量测序方法

同大多数高通量测序一样，Ribo-seq及相关测序文库构建同样面临各种挑战。显著影响Ribo-seq数据质量的因素主要有两个：核糖体保护的mRNA片段的收集，以及mRNA高通量测序文库的构建（图2）。其中，mRNA片段的质量决定了Ribo-seq数据的精准度。在这个过程中，裂解细胞收集富集核糖体的mRNA、RNA酶消化未被核糖体保护的RNA片段等过程是获得高质量mRNA片段的关键。测序文库的构建主要影响mRNA片段在文库中的相对丰度。目前常用的方法均可能导致特异性富集部分mRNA片段，导致核糖体位置推断出现系统性偏差。此外，Ribo-seq已开始逐渐应用于单细胞层面翻译组研究。在单细胞Ribo-seq中，高质量mRNA片段的获得及无偏差的文库构建对Ribo-seq的数据质量尤其重要，因此系统评估Ribo-seq的数据质量是确保获得可信结果的关键前提。

图2 核糖体测序质量控制

该论文以“Principles, Challenges, and Advances in Ribosome Profiling: From Bulk to Low-Input and Single-Cell Analysis”为题发表在Advanced Biotechnology。浙江大学医学院良渚实验室毛圆辉教授为该综述的通讯作者，博士研究生王秋懿为本文的第一作者。该论文得到了国家自然科学基金等项目资助。

Advanced Biotechnology

期刊介绍

Advanced Biotechnology (ABT)是由中山大学主办，中山大学生命科学学院、水产动物疫病防控与健康养殖全国重点实验室、中国-东盟海水养殖技术“一带一路”联合实验室承办，全球知名出版商Springer Nature合作出版的高起点国际期刊。

Advanced Biotechnology采取同行评议、开放获取的方式出版发行，致力于发表生物技术领域的高水平前沿研究，包括生物、农业和医学技术领域的原创发现、新方法和重大技术创新成果。期刊旨在传播突破性的生物技术和方法，引领生物技术领域的国际前沿。

欢迎投稿的主题包括但不限于：多组学技术、医学生物技术、农业生物技术、生物信息学、生命科学中的人工智能、化学生物技术、生物医学工程、计算生物医学、分子与细胞工程、合成生物学、系统生物学、疫苗、转化医学技术、遗传和基因组技术等。

期刊亮点

编委团队由来自中国、美国、英国、法国、加拿大、新加坡、韩国、波兰等国家和地区 50 多名前沿领域科学家组成。

同行评议、开放获取、快速出版(14 天内完成第一轮评审)，为高水平论文开设“绿色通道”快速发表；2023-2026 年所有论文免收出版费。

2023年5月中山大学与Springer Nature正式签署合作协议，6月 ABT期刊编委会成立，7月 ABT期刊网站上线，7月20日投稿系统启用，首期创刊号于2023年10月正式出版。

发展目标：5年内进入国际top期刊行列，打造中国本土前沿生物技术期刊旗舰品牌。

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